Ketua : Muhammad Yasir, MA
Sekretaris : Afriadi Putra, S.Th.I., M.Hum
Anggota :
- Masyhuri, S.P.Si., M.Psi
- Mashuri, MA
- H. Hakim Ma’rifat
- Fitra Lestari Norhiza, MA., Ph.D
- Helmi Candra, M.Ag
- Imam Farih, S.Pd.I
- M. Tibri, M.Pd
- Drs. H. Jasmi Yudo
Ruang lingkup program-program Komisi Pengkajian, adalah sebagai berikut:
- Melakukan kajian terhadap berbagai aliran agama/kepercayaan yang berkembang di tengah masyarakat
- Membuat Buku Panduan Majelis Taklim (Adab-adab Majelis Ilmu)
- Membuat Buku Panduan Ibadah Qurban
- Mengadakan kegiatan ilmiah dalam bentuk seminar, lokakarya, simposium dan dialog untuk membahas masalah-masalah aktual.
- Melakukan sosialisasi hasil pengkajian kepada umat Islam dan masyarakat pada umumnya.